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Biocomputing hub projects
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Characterize inter-individual aging in C. elegans
RNA-Seq
co-encadrement
Francesconi Team
ongoing
Archivage de Gibio par software heritage
Biocomputing Hub
ongoing
Analyse données de Ribosome profiling & RNA-seq
Ribosome profiling
RNA-seq
paused
RMI2 Team
Understanding the origin of evolutionary innovation using water strider propelling fan as a model
scRNA-seq
EvoDevo
Francesconi Team
ongoing
Pipeline Hi-C et nf-core
Hi-C
Nextflow
nf-core
ongoing
Recherche des chromosomes sexuels dans les espèces pseudosexuées Mesorhabditis
methdology development
Delattre team
ongoing
Recherche des séquences éliminées par clustering
methdology development
Delattre team
ongoing
Détéction et quantification de foci de lésion d’ADN
software development
image processing
Bernard Team
Co-Encadrement de stage entre l’INSA-Lyon Biosciences et l’équipe Bernard
Nextflow
ChIP-seq
co-encadrement
Bernard Team
RTqPCR raw data processing
ongoing
software development
R
SBDM Team
Analyser de données de scRTqPCR
scRTqPCR
R
code refactoring
SBDM Team
Traitement de données DamID-seq
Nextflow
DamID-seq
PBC team
Impact des interactions fonctionnelles entre condensine et nucléosomes sur les chromosomes en mitose
MNase-seq
ChIP-seq
Hi-C
co-encadrement
Bernard Team
Développement d’un pipeline d’analyse de ChIP-seq calibré
ChIP-seq
Nextflow
Bernard Team
Identifier un partenariat ou un antagonisme fonctionnel entre diverses RBP
software development
statistical analysis
ReGArDS Team
Exploration of how genetic variation affects chromatin conformation and its impact on gene expression
Nextflow
Francesconi Team
Contamination au saumon des souches de levures de laboratoire
ChIP-seq
RNA-seq
Nextflow
co-encadrement
GCLS Team
Développement d’un programme permettant de savoir si un jeu d’exons se concentre au sein des même isochores TAD ou LAD
Ribosome profiling
RNA-seq
software development
ReGArDS Team
Développement d’un outil informatique capable de séparer les reads en function de barcodes utilisés
Ribosome profiling
RNA-seq
RMI2 Team
Analyse de données RNA-seq et ChIP-seq en se focalisant sur les tRNA/tDNA
RNA-seq
ChIP-seq
Bernard Team
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