Reunion Comité Biocomputing 2023/03/03
Site web Hub Biocomputing
Existant
Page blog pour les informations PSMN, gitbio etc… Page projets recensant les projets du Hub en cours et passés. Page membres listant les membres du Hub Biocomputing, du comité Biocomputing et du comité directif.
Améliorations proposées
Ajout d’une page recensant les outils de bioinfo en ligne. Ajout d’un agenda. Ajout d’une page regroupant les formations passées et leurs supports.
Projets : beaucoup de catégories, difficile de s’y retrouver. Solutions proposées : - Classer par équipe. - Faire des thèmes plus globaux (exemple : 4C et Hi-C = méthodes 3C). - Existance du tag ‘ongoing’, définir des tags pour projets terminés ou en pause. On voit qui participe au projet, on pourrait rajouter son statut. Une image par projet pour illustrer la page et s’y retrouver est une idée.
Questions de reporting/stat : - Sur quelle période a lieu un projet - Possibilité de filtrer par date - Avoir le nom d’équipe et le nombre de personnes impliquées par projet.
Soumission de projets
A la soumission, faire un calendrier de projet : donner une idée du calendrier de publication, de la priorité. Fixer une récurrence de réunions pour faire une mise à jour de l’avancée du projet. Quand un projet est mis en pause, permet de s’occuper de projets non prioritaires.
Formations
Formations de 30h au total (stats). Possibilité de suivre avec les étudiants (a priori plutôt L3 que M1), mais dépendra des effectifs. Si peu de personnes intéressées, en auditeur libre dans les CM (au 1er semestre uniquement), TD/TP selon la place. Si plus de X intéressés (nombre à définir), faire une formation. Si ouvert à tout le SFR biosciences les effectifs devraient être suffisants.
Sensibilisation du public biologique à la modélisation
Organiser des séminaires pour donner une idée aux expérimentalistes de ce qu’ils peuvent demander à des collaborateurs. Présentation de la démarche + formulation du problème : permet de montrer les limites et les pré-requis pour un projet de modélisation.
Montrer ce qu’on peut faire ou ne pas faire (inspiré du cours d’Olivier). Montrer ce qu’un modèle peut apporter à la question biologique ? (Est-ce utile ou non ?).
Il faudrait garder ce séminaire interactif pour ne pas perdre le public.
Cafés biocomputing
Proposer une fois par semaine un créneau avec un bioinfo disponible pour : - préparer des projets - discuter des projets en cours Sous format d’un créneau “open bar” (= “je suis disponible, venez si vous voulez, on discute de ce qu’on veut”). Prévoir un roulement parmi les bioinfos. Prendrait place en salle passerelle/convivialité/là où on mange (un tableau blanc est disponible). Une salle de réunion serait trop formel. A adapter selon l’affluence.